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青海省昆侖英才農業科技創新團隊
學術論文在《Scientific Data》上發表
作者:張小千
發布時間:2025-02-26 23:40:00
編輯:張小千

  青海新聞網·大美青海客戶端訊(記者 張小千 報道)近日,記者從青海省科技廳獲悉,由青海省科技廳重點研發與轉化計劃專項支持的青海大學青海省昆侖英才農業科技創新團隊(青藏高原昆蟲生態與害蟲防治團隊),在自然科學期刊《Scientific Data》(科學數據)上發表學術論文《Genome assembly of the grassland caterpillar Gynaephora qinghaiensis》(青海草原毛蟲基因組組裝)。

  草原毛蟲(Lepidoptera:Lymantriinae:Gynaephora)是一個小型昆蟲類群,全世界記錄有15個物種,分布在北極凍土帶和北半球的高海拔地區。在中國,所有8個被命名的Gynaephora物種都棲息在海拔2900米至5000米的青藏高原地區。草原毛蟲是青藏高原高寒草甸最具破壞性的害蟲,不僅取食牧草可導致嚴重的飼草短缺和草地退化,還會引起家畜和野生動物的口腔黏膜潰瘍。

  研究組就青海草原毛蟲(Gynaephora qinghaiensis)的基因組進行了組裝。組裝后的基因組大小為861.04Mb,由107個contig組成,contig N50大小為18.65Mb。BUSCO分析顯示,組裝體中含有99.56%(99.27%完整、0.29%片段化)的BUSCO基因。在G.qinghaiensis基因組中,預測有580.2Mb(占基因組的67.4%)的重復序列和16 618個蛋白質編碼基因。系統發育基因組學分析表明,G.qinghaiensis與銹色卷蛾Orgyia antiqua大約在1830萬年前分化。此外,基因家族進化分析表明,在G.qinghaiensis基因組中,有130個基因家族顯著擴張、43個基因家族收縮。參考基因組的可用性,可為揭示草原毛蟲對高海拔環境的適應性進化機制提供遺傳資源,有助于制定草原毛蟲的綜合防控策略。

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青海省昆侖英才農業科技創新團隊
學術論文在《Scientific Data》上發表

  • 2025-02-26 11:40:00
  • 來源:青海新聞網

  青海新聞網·大美青海客戶端訊(記者 張小千 報道)近日,記者從青海省科技廳獲悉,由青海省科技廳重點研發與轉化計劃專項支持的青海大學青海省昆侖英才農業科技創新團隊(青藏高原昆蟲生態與害蟲防治團隊),在自然科學期刊《Scientific Data》(科學數據)上發表學術論文《Genome assembly of the grassland caterpillar Gynaephora qinghaiensis》(青海草原毛蟲基因組組裝)。

  草原毛蟲(Lepidoptera:Lymantriinae:Gynaephora)是一個小型昆蟲類群,全世界記錄有15個物種,分布在北極凍土帶和北半球的高海拔地區。在中國,所有8個被命名的Gynaephora物種都棲息在海拔2900米至5000米的青藏高原地區。草原毛蟲是青藏高原高寒草甸最具破壞性的害蟲,不僅取食牧草可導致嚴重的飼草短缺和草地退化,還會引起家畜和野生動物的口腔黏膜潰瘍。

  研究組就青海草原毛蟲(Gynaephora qinghaiensis)的基因組進行了組裝。組裝后的基因組大小為861.04Mb,由107個contig組成,contig N50大小為18.65Mb。BUSCO分析顯示,組裝體中含有99.56%(99.27%完整、0.29%片段化)的BUSCO基因。在G.qinghaiensis基因組中,預測有580.2Mb(占基因組的67.4%)的重復序列和16 618個蛋白質編碼基因。系統發育基因組學分析表明,G.qinghaiensis與銹色卷蛾Orgyia antiqua大約在1830萬年前分化。此外,基因家族進化分析表明,在G.qinghaiensis基因組中,有130個基因家族顯著擴張、43個基因家族收縮。參考基因組的可用性,可為揭示草原毛蟲對高海拔環境的適應性進化機制提供遺傳資源,有助于制定草原毛蟲的綜合防控策略。

作者 張小千
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